Processing and quality control of DNA array hybridization data

نویسندگان
چکیده

برای دانلود رایگان متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Processing and quality control of DNA array hybridization data

MOTIVATION The technology of hybridization to DNA arrays is used to obtain the expression levels of many different genes simultaneously. It enables searching for genes that are expressed specifically under certain conditions. However, the technology produces large amounts of data demanding computational methods for their analysis. It is necessary to find ways to compare data from different expe...

متن کامل

Custom Array Comparative Genomic Hybridization: the Importance of DNA Quality, an Expert Eye, and Variant Validation

The presence of false positive and false negative results in the Array Comparative Genomic Hybridization (aCGH) design is poorly addressed in literature reports. We took advantage of a custom aCGH recently carried out to analyze its design performance, the use of several Agilent aberrations detection algorithms, and the presence of false results. Our study provides a confirmation that the high ...

متن کامل

effect of seed priming and irrigation regimes on yield,yield components and quality of safflowers cultivars

این مطالعه در سال 1386-87 در آزمایشگاه و مزرعه پژوهشی دانشگاه صنعتی اصفهان به منظور تعیین مناسب ترین تیمار بذری و ارزیابی اثر پرایمینگ بر روی سه رقم گلرنگ تحت سه رژیم آبیاری انجام گرفت. برخی از مطالعات اثرات سودمند پرایمینگ بذر را بر روی گیاهان مختلف بررسی کرده اند اما در حال حاضر اطلاعات کمی در مورد خصوصیات مربوط به جوانه زنی، مراحل نموی، عملکرد و خصوصیات کمی و کیفی بذور تیمار شده ژنوتیپ های م...

Improving DNA array data quality by minimising 'neighbourhood' effects.

Gene expression studies using cDNA arrays require robust and sensitive detection methods. Being extremely sensitive, radioactive detection suffers from the influence of signals positioned in each other's vicinity, the 'neighbourhood' effect. This limits the gene density of arrays and the quality of the results obtained. We have investigated the quantitative influence of different parameters on ...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Bioinformatics

سال: 2000

ISSN: 1367-4803,1460-2059

DOI: 10.1093/bioinformatics/16.11.1014